ISH・IHC・FISH の比較表
| 項目 | ISH（In Situ Hybridization） | IHC（Immunohistochemistry：免疫組織化学） | FISH（Fluorescence In Situ Hybridization） |
|---|---|---|---|
| 検出対象 | DNAやRNA（遺伝子配列、mRNA発現） | タンパク質（抗原） | DNAやRNA（特に染色体や遺伝子配列） |
| 原理 | 相補的な核酸プローブと標的配列のハイブリダイゼーション | 抗原抗体反応 | ISHの一種。蛍光標識プローブでハイブリダイゼーション |
| 標識方法 | 蛍光・酵素・放射性同位体など | 酵素標識抗体（DAB発色など）、蛍光標識抗体 | 蛍光色素（FITC, Cy3, Cy5など） |
| 検出機器 | 光学顕微鏡、蛍光顕微鏡、オートラジオグラフィー | 光学顕微鏡（発色）、蛍光顕微鏡 | 蛍光顕微鏡 |
| 得られる情報 | ・遺伝子の局在 ・mRNA発現パターン | ・タンパク質の局在 ・発現量 | ・染色体異常 ・遺伝子増幅や欠失 ・転座の有無 |
| 主な応用 | ・がんの遺伝子診断 ・ウイルス感染の検出 ・発生学研究 | ・がん病理診断（HER2、p53など） ・炎症や感染症での抗原検出 | ・染色体異常（ダウン症など） ・がんにおける遺伝子異常（BCR-ABL転座など） |
| 長所 | 遺伝子レベルでの発現を直接確認できる | タンパク質を直接確認できる（機能的指標） | 染色体異常や遺伝子コピー数を高感度に検出可能 |
| 短所 | 感度がやや低いことがある | 翻訳後修飾や抗体特異性に依存 | 蛍光顕微鏡が必須、シグナル退色の問題 |
まとめ
- ISH：DNA/RNAの局在を見る（遺伝子レベル）
- IHC：タンパク質の局在を見る（機能レベル）
- FISH：ISHの蛍光版で、特に染色体異常や遺伝子コピー数解析に強い